Des envahisseurs d’un autre monde attaquent sans préavis, déchaînant un nouveau type de menace : des armes baptisées « êtres mécaniques ». Devant cette insurmontable menace, l’humanité doit évacuer la Terre et se réfugier sur la Lune.
Le Conseil de l’Humanité met sur pied une force de résistance composée de soldats androïdes afin de reprendre la planète. Pour sortir de l’impasse, la résistance envoie une nouvelle unité d’infanterie androïde : YoRHa.
Sur les terres dévastées de la planète bleue, la guerre fait rage entre machines et androïdes. Une guerre qui lèvera bientôt le voile sur une vérité perdue de ce monde...