Předchozí příběh...
První hra ze série, Marvel's Spider-Man, sleduje asistenta laboratorního výzkumu Petera Parkera, který už osm let vede tajný dvojí život, chrání nevinné civilisty marvelovského New Yorku a zároveň se snaží zvládat svůj chaotický osobní život. Zkušený superhrdina Spider-Man vyšetřuje záhadný gang a snaží se zastavit novou smrtící biologickou zbraň.
Po dvanácti měsících v Marvel's Spider-Man: Miles Morales teenager Miles pod Peterovým dohledem ovládá své pavoučí schopnosti a stává se vlastní verzí Spider-Mana.
Když Miles chrání město v Peterově nepřítomnosti, čelí zuřící válce o území a poznává, jaká je skutečná cena za to, že se stal hrdinou.
O devět měsíců později Peter a Miles spojí své síly ve hře Marvel's Spider-Man 2, aby společně čelili dosud nejtěžší zkoušce v masce i bez ní, když budou muset najít rovnováhu mezi svými životy, přátelstvím a povinností chránit ty, kteří to potřebují, zatímco hrozí, že monstrózní Venom všechno zničí.