Psihotična umjetna inteligencija SHODAN preuzela je kontrolu nad postajom Citadel i pretvorila njezinu posadu u kiborge i mutante.
Moraš se boriti s tim neprijateljima i zaustaviti SHODAN prije nego što učini Zemlji ono što je učinila toj svemirskoj postaji koja je otišla k vragu.
Zaustavi SHODAN i spriječi uništenje čovječanstva. Njezino uništenje naše je spasenje.