Psykoottinen tekoäly SHODAN on ottanut Citadel Stationin hallintaansa ja muuttanut sen henkilöstön kyborgeiksi ja mutanteiksi.
Sinun on taisteltava tiesi läpi näiden vihollisten ja pysäytettävä SHODAN ennen kuin hän tekee Maasta samanlaisen Helvetin kuin tästä avaruusasemasta.
Pysäytä SHODAN ja estä ihmiskunnan tuho. Hänen eliminoimisensa on meidän pelastuksemme.