LEGO® MarvelTM Super Heroes apresenta uma história original que percorre todo o Universo Marvel. Os jogadores assumem o controle do Homem de Ferro, Homem Aranha, Hulk, Capitão América, Wolverine e muitos outros personagens Marvel enquanto se unem para impedir que Loki e outros vilões da Marvel montem uma arma poderosa, capaz de destruir o mundo. Os jogadores perseguirão Cosmic Bricks enquanto cruzam uma Manhattan de LEGO e visitam locais importantes do universo Marvel, como a Stark Tower, Asteroid M, uma base da Hydra e a Mansão-X.