Persona 5 es un juego sobre los conflictos internos y externos de un grupo de estudiantes secundarios con problemas: el protagonista y un grupo de compatriotas que conoce en la historia del juego y que viven una doble vida como "Ladrones fantasmales". Tienen la rutina típica de los adolescentes tokiotas: van a clase, realizan actividades extraescolares y trabajan tiempo parcial. Pero también viven aventuras fantásticas con el uso de poderes sobrenaturales que les permiten ingresar en el corazón de otras personas. Su poder proviene de la Persona o Arquetipo, el concepto junguiano del "sí mismo"; los héroes del juego se percatan de que la sociedad obliga a las personas a usar máscaras para proteger sus vulnerabilidades más íntimas, por eso, al quitarse la máscara protectora y enfrentarse a su ser interior, los protagonistas logran despertar su poder interno para ayudar a los que lo necesitan. El fin último del grupo de Ladrones fantasmales consiste en modificar su vida cotidiana para que concuerde con su percepción y penetre las máscaras que usa la sociedad moderna.