Kena, nu en dygtig åndevejleder, rejser til den mystiske ø Kosmora for at finde svar på sin barndoms sorg.
Der opdager hun en glemt og farlig form for åndemaning, der manipulerer elementernes magt. Med hjælp fra nye Spirit Companions kæmper hun mod storslåede bosser og løser gåder ved at udnytte deres elementarevner.
Mod og dygtighed er nøglen til at vække oldtidens templer, der er knyttet til Kosmoras skjulte fortid. Kena og hendes allierede må arbejde sammen for at udrydde en mægtig trussel mod landet.
Mens rejsen for at hjælpe øen og dens indbyggere bringer hende tættere på sandheden, må Kena konfrontere sårene fra sin egen fortid for at lykkes.